Ahiru no Sora bercerita tentang seorang anak SMA bernama Sora Kuramatani yang berjanji kepada ibunya yang seorang mantan atlet Timnas Wanita Jepang, akan meraih prestasi di turnamen antar SMA.
Namun, impian Sora tersebut harus melalui jalan yang terjal karena tim basket laki-laki di SMA Kuzuryu tempat ia bersekolah ternyata sedang vakum dan tak menerima anggota baru.
Dari situlah petualangan Sora untuk menepati janji kepada ibunya untuk berprestasi di Inter-High, dimulai.
